Do zadań Mazowieckiej Jednostki Wdrażania Programów Unijnych związanych z wdrażaniem Regionalnego Programu Operacyjnego Województwa Mazowieckiego (RPO WM) należą w szczególności:
przygotowywanie i aktualizacja opisów procedur i podręczników wdrażania RPO WM zgodnie z wytycznymi Instytucji Zarządzającej i przekazywanie ich do Instytucji Zarządzającej celem ich zatwierdzenia;
współpraca z Instytucją Zarządzającą w przygotowywaniu szczegółowego opisu Priorytetów RPO WM;
przygotowywanie wzorów wniosków aplikacyjnych, umów i innych dokumentów dla beneficjentów zgodnie z wytycznymi Instytucji Zarządzającej;
opracowywanie rocznej i wieloletniej prognozy wydatków w ramach Priorytetu i przekazywanie ich do Instytucji Zarządzającej;
prowadzenie procedur konkursowych służących wyłonieniu przez Zarząd Województwa Mazowieckiego projektów, które będą dofinansowane w ramach RPO WM;
przygotowywanie projektów umów o dofinansowanie projektów;
dokonywanie płatności ze środków RPO WM na rzecz beneficjentów;
monitorowanie rzeczowego i finansowego postępu w realizacji projektów i weryfikacja sprawozdań i wniosków o płatność sporządzanych przez beneficjentów;
kontrola realizacji poszczególnych projektów dofinansowanych w ramach RPO; WM
odzyskiwanie kwot nienależnie wypłaconych beneficjentom;
prowadzenie systemu rejestrowania i przechowywania w formie elektronicznej szczegółowych rejestrów księgowych dla każdego projektu oraz gromadzenia danych niezbędnych dla zarządzania finansowego, monitoringu, weryfikacji, audytów i oceny;
prowadzenie elektronicznego systemu monitorowania realizacji projektów i priorytetów,
prowadzenie działań informacyjnych i promocyjnych;
przechowywanie wszelkiej dokumentacji związanej z realizacją projektów przez okres 3 lat od daty zamknięcia projektu;
realizacja zadań związanych z wykorzystaniem środków Pomocy Technicznej w ramach RPO WM.